Los Parques Nacionales en la Patagonia, junto con sus áreas naturales, cubren un total de 14 áreas protegidas entre los que se destacan los bosques petrificados, el área de apareamiento de la Ballena Franca Austral, el Glaciar Perito Moreno, y los bosques de Arrayanes.
El sistema de Parques Nacionales en Argentina ayuda a la conservación de la diversidad natural y cultural de la región, donde es posible vincula conservación con el desarrollo sustentable para generar beneficios mutuos. Este sistema tiene más de 70 años en el país.
La buena infraestructura no solo se refiere al alojamiento, los puestos de andinismo, los medios de locomoción necesarios y la asistencia por parte del personal de los Parques Nacionales o "Guarda Parques" . Permanentemente se suman servicios al visitante como el Proyecto "Huella Andina" que conecta mediante nuevos senderos cuatro Parques Nacionales en la Patagonia, en una extensión de 540 km. nunca antes abiertos al turismo.
Además de los Parques Nacionales existen circuitos como la "Ruta de los siete lagos" en Neuquén. Este circuito comprende los lugares situados entre Bariloche, Villa La Angostura y San Martín de los Andes, por lo que puede hacerse tomando cualquiera de los dos puntos de partida, y posee unos 110 km. de recorrido que puede hacerse en auto, bicicleta o contratando un Tour.
Monumento Natural Ballena Franca Austral
Monumento Natural Bosques Petrificados
Monumento Natural El Huemul
Parque Nacional Lago Puelo
Parque Nacional Laguna Blanca
Parque Nacional Lanín
Parque Nacional Lihue Calel
Parque Nacional Los Alerces
Parque Nacional Los Arrayanes
Parque Nacional Los Glaciares
Parque Nacional Monte León
Parque Nacional Nahuel Huapi
Parque Nacional Perito Moreno
Parque Nacional Tierra del Fuego